夏侯瑭，心存复国之志，正隐于谷中勤练独孤九剑。夏侯瑭不知公主身份，救她于危难中，公主心存好感。谷外，公主和赛小菁再遇柳若雄。柳若雄屈服于燕国师的威逼利诱，盗去公主玉箫。公主早已洞悉，以假玉箫调换。
赛小菁不耻丈夫所为，独保公主寻战神将军，协助复国。公主离谷，夏侯瑭为情所困，疏于习武；姑姑（惠英红）为迫其练剑，将公主捉回谷中。夏侯瑭不愿强人所难，将其放走；公主留下玉箫，以报真情。燕国师带兵闯入谷中残杀居民。赛小菁终于找到退隐江湖的战神将军，赶至谷中与公主相会，战神将军击退燕国师，却身受重伤，武功尽废。夏侯瑭惊悉公主身份，误以为感情被骗，悲伤中误斩姑姑，断情绝义终练成独孤九剑。河川节度使德康与柳若雄各怀心事迎接公主玉驾。德康以毒酒迫战神将军说出玉箫秘密，战神将军宁死不屈。公主及赛小菁识破德康与柳若雄阴谋，设计令二人自相残杀后，兵马一日散尽。
翌日，练成独孤九剑的夏侯瑭找公主寻仇，燕国师突现，迫公主交出玉箫。夏侯瑭以独孤九剑杀死燕国师，复刺长安公主。公主却不闪避，血染宝剑。夏侯太子心中顿悟，与公主并肩将玉箫、宝剑抛下山崖，双双归隐，成就神仙眷侣。赛小菁步战神将军后尘，亦终老泉林。
“清音俗世流，纷争何时休；谁能破名利，太虚任遨游。”女管家艾伊轻声诵出一夜相守后，长安公主馈赠夏侯太子复国玉箫时所留书信。
“一分成九，九剑归一。那飘逸的轻功，锋利的剑气，是很多人童年记忆中独孤九剑应有的样子啊。”吴尘笑道：“秒天秒地秒空气，被戏称为‘最强版独孤九剑’。”
“话说，绝世财宝和绝世宝剑，会不会被人从崖下捡回来？”九尾妖后苏妲己问出所有人的心声。
不得不说，这条剧情线的衍生，在《武侠世界：牢城争霸》十分成立。
